你听说过马来西亚60多间独中的“内战”吗？是的，不止复仇者联盟会发生内战，华文独立中学也会因为制度模式的不同而产生争议。
现在所有的独中教学制度模式，可以归纳为三类：单轨制，强制性双轨制和选择性双轨制。
马来西亚政府一直都不承认统考文凭，这样一来，寒窗苦读6年的独中生，在毕业以后却面临无法就业的现实问题。慢慢地，人们对于孩子未来的保障而忧心。随着时代的变迁，许多独中根据当地社区所需，作出制度上的调整。渐渐地越来越多独中采用双轨制进行教学。
如今，采用选择性双轨制的独中已占大部分，成为独中的主流制度模式，而部分的独中采用强制性双轨制，校方将课纲进行适当的调整，以统考课程为主，SPM政府会考为辅，为毕业生提供就业保障。
不过，独中一向推崇学生要全面发展，在课业之余，也希望同学们踊跃参与课外活动，培养完整的人格和传承中华文化使命。和强制性双轨制的独中不同的是，一般情况下，在选择性双轨制的独中内，校方只有在确保学生有兼顾能力，才会推荐学生就读双轨班或参加“课外辅导班”。
强制性双轨制
- 循人中学
- 坤成中学
- 吉隆坡中华独立中学
- 巴生中华独立中学
- 芙蓉中华中学
- 培南独立中学
- 沙巴崇正中学
- 亚庇建国中学
- 沙巴保佛中学
- 丹南崇正中学
- 巴华中学
- 古达培正中学
- 沙巴拿笃中学
- 山打根育源独立中学
- 建兴中学
选择性双轨制
